油菜基因组测序组装和群体重测序服务单一来源采购公示

时间: 2020/08/17   作者:   点击:

 湖南农业大学     油菜3个基因组测序组装和1000份群体重测序   拟进行单一来源采购,现将有关事项公告如下:

一、采购项目名称: 油菜3个基因组测序组装和1000份群体重测序  。预算金额:  人民币 77.16万元  

二、编号(无需填写)

1.采购计划编号:                      

2.采购代理编号:  NDZB-DY202001    

三、拟采购货物或者服务的说明

1、基本信息

序号

品目分类

品目名称

数量

单价

预算(元)

1

(无需填写)

DNA提取和建库

1000

300

300000

2

 

F2代个体重测序

1000

300

300000

3

 

三代基因组测序

3

22000

66,000

4

 

三代基因组组装

3

11000

33,000

5

 

Hi-C辅助基因组组装

3

18000

54,000

6

 

RNA-seq测序及分析

3

1200

3,600

7

 

基因组survey

3

5000

15,000

 

2、详细说明

品目分类

标的名称

标的主要需求

备注

技术需求

服务需求

1

油菜DNA提取和建库

高通量试剂盒提取纯化,500bp文库.

提取和建库按照目前最高标准执行,并同意甲方派2名项目相关的工作人员到公司监督实验过程,确保各环节所有样品编号不出错;测序后返回所有DNA样品。

 

2

油菜F2代个体重测序

双端150bp,5G clean data/个,平均Q30≥90%

 

3

油菜杂交亲本三代基因组测序

30kb文库,120-140G/lane,平均读长18kb,N5027kb

 

4

三代基因组组装

Contig N50>2Mb, Scaffold N50>5Mb

培训2名甲方的项目相关的工作人员学习相关分析技能。

 

 

5

Hi-C辅助基因组组装

120-140G/,95%挂载率

 

6

RNA-seq测序及分析

10G clean data/个,平均Q30≥90%

大数据通过硬盘邮寄。

 

7

基因组Survey

平均30×覆盖评估

准确评估基因组情况,给予三代测序组装指导。

 

 

四、拟定单一来源采购供应商的名称、地址(请同时提供供应商的营业执照组织机构代码证供应商联系人的身份证明 复印件)

1、供应商名称(营业执照上的准确名称): 武汉古奥基因科技有限公司    

2、公司组织机构代码:         MA4KMLTG-5                     

3、企业规模及公司所在行政区域:   50-99        湖北省武汉市      

4、公司详细地址及邮政编码: 武汉东湖新技术开发区汤逊湖北路36号新能源研发基地3号楼303     

5、联系人及联系人身份证号:  刘泽华,  429004198801******           

6、联系人联系电话、传真:   18062743952,   027-59107316          

7、联系E-mail:       liuzh@gooalgene.com                   

8、公司注册资金:   578.5715万元;

9、公司社保登记证号42010815915016  ;营业执照注册号:  91420100MA4KMLTG5F

税务登记证号: 91420100MA4KMLTG5F              

银行账号: 3202163809060048805开户银行: 工行民族大道支行  

(以上信息需上报到省财政厅的数据库,直接牵涉到采购后续付款事宜,请认真填写,并发供应商核对无误后再提交。)

 

五、第三方专家对供应商专利、产品专有技术等唯一性论证的意见

论证时间

2020720

论证地点

  油料改良中心会议室

论证意见

 

为了全面解析油菜高油酸等农艺性状的杂种优势的调控基因和形成机制,需要对湘杂油991和湘杂油992的杂交组合亲本及其遗传群体分别进行三代基因组测序组装和二代重测序,对其进行全基因组的变异鉴定和表型位点的定位,本项目为油菜高油酸育种及相关农艺性状的改良研究提供了重要的数据基础,供应商武汉古奥基因科技有限公司在基因组组装和染色体挂载方面有独到的经验,基于同一物种同样数据量,该公司能提供质量参数最高的基因组,且Hi-C染色体挂载率也是最高的,能保证本项目得到高质量基因组,且该公司的项目报价比其他公司更优惠。此外,该公司还提供了非常完善的个性化服务,不仅同意甲方监督全实验过程,还为甲方培训两名项目相关的分析人员,有助于甲方项目的顺利进行及人才培养,这些都是其它生物公司不能提供的,为本项目的顺利实施提供了必要的保障。经过专家组详细论证,一致同意实施本项目,并由唯一供应商武汉古奥基因科技有限公司负责实施。

 

专家成员名单

姓名

工作单位

职称

侯树敏

安徽省农业科学院

研究员

杨庆勇

华中农业大学

副研究员

 

福建农林大学

副研究员

 

 

 

六、公示期限:

2020  8 17  日至  2020   8   24 日止,共计5个工作日。任何供应商、单位或个人对采用单一来源方式公示有异议的,可以向采购人、采购代理机构以书面形式实名反映,并抄报财政部门。

七、采购人和采购代理机构名称、联系人和联系方式

1采购人名称: 湖南农业大学

  址: 长沙市芙蓉区农大路1 

联系人:  欧阳老师  联系电话:  0731-84635280  

申请人:官老师, 联系邮箱:  972696327@qq.com

2、代理机构名称:   湖南农业大学采购与招标中心

地址: 长沙市芙蓉区农大路1号思源馆

联系人:马老师     联系电话:  0731-84618118

八、其他

任何供应商、单位或者个人对采用单一来源采购方式公示有异议的,可以在公示期内将书面意见反馈给采购人、采购代理机构,并同时抄送湖南省财政厅政府采购处。

 本公告期限不得少于5个工作日。

20208 15